De belangrijkste thema's in het werk van Erwin Mortier zijn de zoektocht naar identiteit, de invloed van de geschiedenis op het individu en de menselijke relaties. Hij verkent vaak de complexiteit van emoties en hoe deze worden gevormd door de omgeving en ervaringen van de personages.
Typische stijlkenmerken van de boeken van Erwin Mortier zijn zijn poëtische proza, rijke beschrijvingen en het gebruik van metaforen. Mortier staat bekend om zijn zorgvuldig opgebouwde zinnen en zijn vermogen om diepere emoties over te brengen zonder in clichés te vervallen.
Mortiers werk speelt vaak in verschillende Vlaamse steden zoals Brugge en Gent. Deze locaties vormen een belangrijk decor voor zijn verhalen, waarbij hij de karakteristieken van deze steden prachtig verweeft met de narratieve structuur.
De personages in Mortiers boeken zijn vaak diepgaand en gelaagd, met een sterke aandacht voor hun innerlijke leven. Dit maakt hen herkenbaar en authentiek. Lezers kunnen zich vaak in hun twijfels, vreugdes en angsten herkennen, waardoor de personages levensecht overkomen.
Erwin Mortier heeft de hedendaagse Vlaamse literatuur sterk beïnvloed door zijn vernieuwende vertelstijl en de thematiek die hij aansnijdt. Hij heeft bijgedragen aan de vernieuwing van de Vlaamse roman door onderwerpen te behandelen die vaak worden genegeerd, en hierdoor heeft hij ook andere schrijvers geïnspireerd om meer persoonlijke en introspectieve verhalen te vertellen.